164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4027 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
296 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  68.23 
 
 
305 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  70.82 
 
 
285 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  70.82 
 
 
285 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  68.33 
 
 
298 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  65.96 
 
 
320 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  67.26 
 
 
308 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  61.45 
 
 
301 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  59.86 
 
 
304 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 
278 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  45.55 
 
 
275 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  48.36 
 
 
299 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  44.96 
 
 
301 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  42.86 
 
 
276 aa  235  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  41.52 
 
 
284 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  44.61 
 
 
276 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  43.59 
 
 
282 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  44.69 
 
 
276 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
309 aa  225  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.97 
 
 
603 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 
276 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  38.05 
 
 
295 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 
295 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.73 
 
 
607 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
309 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 
323 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  39.86 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
308 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  37.75 
 
 
305 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
302 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
301 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
322 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  36.04 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
313 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  36.24 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  34.48 
 
 
294 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
284 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  35.49 
 
 
320 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.71 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  33.57 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.15 
 
 
323 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
287 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.51 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  22.82 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.27 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.98 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.29 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  24.63 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  23.19 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.73 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.8 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  27.98 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.87 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.01 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  22.54 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  22.38 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.82 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.87 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  23.58 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.82 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.47 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  21.23 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.8 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  22.04 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.72 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.31 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  23.7 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  23.81 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.12 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.47 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  21.64 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.36 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  22.46 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  22.46 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  22.46 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>