More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0877 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  86.19 
 
 		 607 aa  940    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 603 aa  1193    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  42.25 
 
 		 275 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 295 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 		 308 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  39.4 
 
 		 296 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 309 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  37.37 
 
 		 284 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  40.77 
 
 		 301 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  41.11 
 
 		 295 aa  210  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 		 320 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  40.59 
 
 		 304 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  38.83 
 
 		 298 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  40.21 
 
 		 305 aa  203  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 285 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 285 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  35.97 
 
 		 294 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 322 aa  193  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  37.54 
 
 		 280 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  40.82 
 
 		 279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 		 283 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  39.59 
 
 		 278 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  40.21 
 
 		 302 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 333 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 		 284 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  41.8 
 
 		 282 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.82 
 
 		 279 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.94 
 
 		 681 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  35.46 
 
 		 305 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.27 
 
 		 319 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  52.17 
 
 		 323 aa  157  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  37.11 
 
 		 280 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  33.8 
 
 		 276 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  48.1 
 
 		 316 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.69 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 		 276 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 276 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.63 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 301 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 		 320 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  45.91 
 
 		 320 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  47.8 
 
 		 327 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  48.08 
 
 		 595 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 313 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.51 
 
 		 506 aa  143  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  47.5 
 
 		 694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  47.4 
 
 		 341 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  42.31 
 
 		 794 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  48.3 
 
 		 323 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  45.57 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  51.85 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 323 aa  140  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.67 
 
 		 327 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  43.53 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  43.05 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 		 1550 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.68 
 
 		 348 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.68 
 
 		 348 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  42.38 
 
 		 431 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  31.84 
 
 		 276 aa  137  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.88 
 
 		 780 aa  137  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.67 
 
 		 878 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00678  Putative signal protein with GAF, GGDEF and EAL domains  48.34 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0927231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  43.95 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  47.13 
 
 		 669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.45 
 
 		 624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.3 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.22 
 
 		 864 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.8 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.4 
 
 		 367 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.94 
 
 		 322 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.8 
 
 		 323 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.4 
 
 		 318 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  41.36 
 
 		 400 aa  134  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  48.92 
 
 		 245 aa  134  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46 
 
 		 321 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.26 
 
 		 323 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  44.03 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.58 
 
 		 722 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  45.58 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.01 
 
 		 1965 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.9 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 		 308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  44.9 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.83 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  44.9 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  38.36 
 
 		 314 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  43.93 
 
 		 276 aa  132  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  46.43 
 
 		 497 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  47.48 
 
 		 438 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.48 
 
 		 442 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 416 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 		 934 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 287 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.98 
 
 		 722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  44.65 
 
 		 743 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>