77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1994 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 320 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  46.11 
 
 		 323 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  49.06 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  33.75 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.83 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  31.89 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  31.85 
 
 		 284 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.27 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  30.74 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  32.33 
 
 		 603 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 283 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  34.47 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  31.51 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  37.08 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  33.46 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  32.02 
 
 		 607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  30.03 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  29.91 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  30.11 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  29.18 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  25.19 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  28.93 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.7 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  24.78 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.98 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  24.87 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  29.46 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  29.46 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  22.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  29.46 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  29.46 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  22.92 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  22.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  22.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  22.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  22.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  21.48 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  24.91 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  29.05 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>