157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1865 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  100 
 
 
305 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  68.23 
 
 
296 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  70.04 
 
 
308 aa  437  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  66.21 
 
 
298 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  69.93 
 
 
285 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  69.93 
 
 
285 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  64.36 
 
 
320 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  60.36 
 
 
301 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  58.91 
 
 
304 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  43.93 
 
 
278 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  49.27 
 
 
299 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  42.7 
 
 
275 aa  252  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  44.32 
 
 
301 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  42.75 
 
 
284 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  42.91 
 
 
282 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  37.86 
 
 
276 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  39.41 
 
 
276 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
276 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.21 
 
 
603 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
333 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
276 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 
309 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  36.7 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
301 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  37.75 
 
 
305 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  40.48 
 
 
607 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 
289 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 
308 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
301 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 
349 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 
323 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 
313 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  35.54 
 
 
280 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
322 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
283 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  34.72 
 
 
279 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 
284 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  35.43 
 
 
279 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  32.29 
 
 
294 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  36.71 
 
 
320 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
287 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  32.35 
 
 
280 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 
320 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.13 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.97 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.18 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.77 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.06 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  21.04 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.21 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.7 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.7 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.7 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.7 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.7 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  23.03 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.57 
 
 
393 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  21.54 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.25 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.07 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  23.59 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.4 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  25.08 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.9 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  24.38 
 
 
248 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.22 
 
 
235 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  32.61 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
270 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25.95 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.07 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.41 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.67 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.07 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.09 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.21 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  22.19 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
248 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
252 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.21 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
248 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  25.64 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  30 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.69 
 
 
265 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>