85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4920 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
349 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  91.36 
 
 
301 aa  567  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  69.02 
 
 
313 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  69.12 
 
 
289 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  69.52 
 
 
308 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  44.07 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  44.81 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  41.48 
 
 
276 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 
276 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  39.39 
 
 
275 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  38.57 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  36.2 
 
 
298 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 
320 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  35.69 
 
 
305 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 
308 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  34.86 
 
 
301 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  32.27 
 
 
304 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
309 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  33.45 
 
 
284 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 
279 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  30.51 
 
 
295 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  33.45 
 
 
603 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  31.58 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  34.86 
 
 
607 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 
322 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
295 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
309 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
302 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  25.09 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.21 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  30.36 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  30.59 
 
 
280 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  26.12 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.87 
 
 
320 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.31 
 
 
299 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 
284 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.54 
 
 
243 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  27.52 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  23.18 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  22.67 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
235 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  34.69 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.21 
 
 
364 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 
327 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  23.28 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.72 
 
 
322 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.43 
 
 
323 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.17 
 
 
393 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.75 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  24.92 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4185  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  19.14 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.74 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.64 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.68 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4556  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.305264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  31.65 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0439  ribonuclease Z  22.22 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
323 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  24.91 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07370  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily I  26.47 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.118565  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
252 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1818  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily II-like protein  29.5 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>