More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1360 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  100 
 
 		 316 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  93.99 
 
 		 316 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  42.99 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  40.5 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  38.78 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  37.17 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.91 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  34.91 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  32.69 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  35.41 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  33.87 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  32.25 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  32.7 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  31.72 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  35.76 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  32.57 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  31.07 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  31.8 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.18 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.03 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  32.46 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  32.79 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.54 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  33.54 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  31.03 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  30.92 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  31.72 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  29.19 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  32.78 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  31.01 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0439  ribonuclease Z  31.67 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  28.66 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  30.09 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.28 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  30.09 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.43 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.06 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  31.11 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  29.78 
 
 		 304 aa  126  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  28.06 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  30.57 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  29.56 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  31.37 
 
 		 315 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  27.87 
 
 		 373 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  30.79 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  30.79 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  29.65 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.64 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  31.08 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  28.8 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  31.53 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  30.56 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  30.16 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  29.85 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.36 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  31.36 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  30.19 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  28.97 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  28.66 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  29.32 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.61 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  30.03 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.32 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  27.11 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  29.76 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  26.07 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  26.69 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  27.05 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  27.69 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  29.9 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  28.82 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  28.39 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.79 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>