99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3215 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  617  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  63.61 
 
 
295 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  41.11 
 
 
603 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
285 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
285 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 
309 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.09 
 
 
607 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 
308 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
296 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  37.54 
 
 
298 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  38.7 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  38.29 
 
 
301 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  37.41 
 
 
320 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.69 
 
 
275 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  35.25 
 
 
304 aa  185  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  33.57 
 
 
284 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  30.07 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
322 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  33.94 
 
 
280 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  31.83 
 
 
278 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  32.77 
 
 
279 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 
283 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.69 
 
 
279 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
309 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
276 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  30.8 
 
 
276 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.89 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.8 
 
 
323 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.25 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  28.57 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 
282 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
308 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
287 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  30.27 
 
 
301 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
349 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
301 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  29.1 
 
 
280 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  30.11 
 
 
299 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  23.44 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.33 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  25.32 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.14 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  22.89 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.74 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  22.83 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.3 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  21.3 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.73 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.27 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.67 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  21.04 
 
 
263 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.48 
 
 
308 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.11 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.08 
 
 
312 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  23.9 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  20.87 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  22.26 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf128  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.42 
 
 
594 aa  44.3  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  20.13 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  19.61 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.11 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  20.13 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.32 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  20.34 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.81 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  21.22 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  20.82 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.11 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.87 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  21.07 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.67 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.75 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>