212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3638 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
309 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  43.48 
 
 
275 aa  254  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
285 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
285 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  41.9 
 
 
320 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
296 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  40 
 
 
298 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  40 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  39.22 
 
 
284 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  38.57 
 
 
301 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  35.94 
 
 
304 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 
309 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
333 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  39.87 
 
 
305 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  39.93 
 
 
603 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  41.09 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  36.75 
 
 
276 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  36.33 
 
 
276 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  40.89 
 
 
607 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
322 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 
276 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  37.41 
 
 
301 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 
276 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  37.26 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  36.92 
 
 
279 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  35.54 
 
 
295 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
313 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 
279 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
289 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 
308 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 
283 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 
349 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  31.54 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 
302 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
295 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  30.29 
 
 
294 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
284 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  34.83 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.85 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  34.31 
 
 
320 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  34.75 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  29.89 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
287 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  30.45 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  31.74 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.72 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.72 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.72 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.72 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.72 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.93 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
248 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.5 
 
 
243 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
252 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.74 
 
 
323 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  31.08 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
249 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
256 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.47 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
235 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  29.34 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  26.86 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  29.86 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.1 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.17 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.17 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.78 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.39 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.67 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  26.64 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  25.57 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.91 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.89 
 
 
259 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.55 
 
 
314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>