124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6342 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  42.09 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  38.11 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  37.06 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  39.93 
 
 		 603 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  37.83 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  37.06 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 308 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  35.02 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  35.47 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  34.48 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  40.82 
 
 		 607 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.66 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  34.47 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  29 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  30.85 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  30 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  30.4 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.76 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  26.15 
 
 		 301 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  30.12 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.2 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  25.42 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  31.25 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  33.14 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  29.15 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  31.47 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.65 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  41.03 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  42.31 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  37.33 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  27.03 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.33 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  28.37 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.86 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.03 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0942  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  25.6 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.24 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  34.41 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.47 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  23.88 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.11 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1937  beta-lactamase-like  24.53 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1887  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000106131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  28.12 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>