More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0415 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  39.41 
 
 
235 aa  165  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
235 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  40.25 
 
 
235 aa  156  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.19 
 
 
306 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  27.3 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  32.44 
 
 
447 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.67 
 
 
308 aa  88.2  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  26.85 
 
 
780 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.09 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  27.84 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.87 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  37.27 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.74 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  26.95 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.27 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.27 
 
 
311 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.27 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.27 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.27 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.58 
 
 
311 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.27 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  27.37 
 
 
310 aa  79  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  30.47 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  30.47 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  30.47 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  30.47 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  30.47 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  33.33 
 
 
748 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.27 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  25.51 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  32.91 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  23.72 
 
 
309 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  33.19 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  32.79 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.85 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.14 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.71 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.39 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.52 
 
 
323 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  32.37 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  28.52 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  24.43 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.83 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.4 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  32.2 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.31 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.71 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.79 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
257 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.03 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  26.46 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  26.46 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  23.64 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  23.64 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  22.75 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  23.64 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  23.64 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  23.64 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.48 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.24 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.98 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  30.91 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  30.3 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.22 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>