226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1656 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.83 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  27.12 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.23 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  25.99 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  28.37 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.05 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.05 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.63 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.44 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  23.57 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  25.66 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.71 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  25.51 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  28.35 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  41.89 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.14 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  24.59 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.87 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  24.37 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.56 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  26 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  25.89 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.51 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  29.75 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.16 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.58 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  29.17 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.2 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  20.68 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.47 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  30.3 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  29.17 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.47 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.41 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 345 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.45 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  29.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  25.61 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  33.71 
 
 		 313 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  25.61 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>