174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0184 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 
265 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.49 
 
 
255 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  37.24 
 
 
255 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.49 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.39 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  23.59 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.18 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  24.3 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  26.78 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  28.8 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.62 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  22.04 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  25.9 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  18.87 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  25.97 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  21.61 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.14 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.1 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  20 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.1 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1589  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0909868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.45 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
303 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  25.57 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.49 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  23.24 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  21.29 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  22.42 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  25 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  22.81 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  31.43 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.52 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  20.99 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  30.68 
 
 
301 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  21.05 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  29.41 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  21.66 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.49 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  22.88 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.66 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  29.41 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  22.03 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  30.59 
 
 
321 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  20.39 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  22.15 
 
 
313 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  28.67 
 
 
306 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  22.32 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  25.78 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  23.03 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  22.03 
 
 
285 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.8 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  22.03 
 
 
285 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 
283 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.68 
 
 
312 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  22.03 
 
 
285 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  23.27 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  20 
 
 
248 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.83 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  21.29 
 
 
323 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  23 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  27.59 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  23.27 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.6 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  25.4 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  21.21 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  22.39 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.96 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  34.57 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  30.97 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>