More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0796 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  66.39 
 
 
244 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  64.34 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  65.98 
 
 
244 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  63.11 
 
 
244 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  53.04 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  52.63 
 
 
243 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  46.53 
 
 
243 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  46.53 
 
 
243 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 
247 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.08 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  29.26 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.69 
 
 
304 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.57 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.83 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
257 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.88 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.4 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.27 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.62 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.62 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  31.73 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.62 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.25 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  27.31 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.27 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.07 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.95 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.82 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.27 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.27 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.35 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.45 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  25.99 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  25.99 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  28.93 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.83 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.91 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  29.17 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.48 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.91 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.57 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.52 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  23.89 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.78 
 
 
309 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.77 
 
 
314 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.18 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  24.7 
 
 
312 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.6 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  25.55 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.6 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.6 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.6 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.81 
 
 
305 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.6 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.55 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  28.17 
 
 
308 aa  62.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.37 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.11 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  36.44 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  28.3 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.97 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  27.53 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.46 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.89 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.8 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  31.2 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>