More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1103 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  89.11 
 
 		 248 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  63.1 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  54.62 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  53.01 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  54.4 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  51.41 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  48.8 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  48.82 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  47.29 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  47.27 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  47.08 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  49.6 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.4 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  42.64 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  40.98 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  43.36 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  39.47 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  43.41 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  43.58 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  41.6 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.39 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.54 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  39.65 
 
 		 284 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  43.41 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  38.72 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  38.35 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  37.05 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  32.03 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  32.36 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  31.3 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  31.3 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  31.3 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  31.3 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  32.58 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  30.49 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30.08 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.14 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  33.21 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 305 aa  88.6  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.76 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.49 
 
 		 318 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  31.05 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.69 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  32.79 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.4 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.76 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  29.96 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.61 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  30.86 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  27.45 
 
 		 314 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.16 
 
 		 323 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>