228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2357 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  94.16 
 
 
257 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  88.24 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  88.24 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  88.24 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  80.93 
 
 
273 aa  428  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  55.14 
 
 
253 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  49.23 
 
 
259 aa  218  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  47.24 
 
 
270 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  46.64 
 
 
248 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 
256 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  46.27 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  44.31 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  44.92 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  41.55 
 
 
284 aa  188  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  42.32 
 
 
267 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.52 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
256 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 
249 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  41.29 
 
 
262 aa  168  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  43.64 
 
 
250 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.63 
 
 
265 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  42.54 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 
248 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40 
 
 
271 aa  158  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  41.64 
 
 
265 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 
246 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  39.18 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.5 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
262 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
249 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
256 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.28 
 
 
250 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  32.73 
 
 
273 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  30.42 
 
 
244 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30.86 
 
 
244 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
244 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  30.35 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.49 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  29.96 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.07 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.41 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.62 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.21 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.12 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.97 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  28.18 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.21 
 
 
315 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1991  ribonuclease Z  29.39 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  37.38 
 
 
345 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  38.46 
 
 
319 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.31 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  35.71 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  35.71 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.25 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.4 
 
 
318 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  36.36 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.62 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.35 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  25.24 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  28.33 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  27.45 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  27.45 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  27.45 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>