218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1059 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  53.68 
 
 
267 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  50.18 
 
 
267 aa  269  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  47.72 
 
 
271 aa  232  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  47.84 
 
 
262 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  45.42 
 
 
256 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  43.46 
 
 
268 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  44.29 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  40.49 
 
 
250 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.69 
 
 
265 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  45.71 
 
 
265 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  41.55 
 
 
257 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  43.51 
 
 
265 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  40.78 
 
 
270 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
248 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  40.81 
 
 
257 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 
257 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 
257 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  40.42 
 
 
273 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 
270 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.36 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 
257 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  39.79 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  38.7 
 
 
259 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 
251 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  38.11 
 
 
250 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
253 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 
248 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
248 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.74 
 
 
250 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
262 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.04 
 
 
258 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
244 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
244 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 
244 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.51 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.51 
 
 
244 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.51 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.25 
 
 
244 aa  92  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 
244 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.82 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.39 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
263 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  30.35 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.49 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  30.08 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.71 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  27.74 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  28.26 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.29 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25.43 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.57 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.57 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  28.88 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  39.34 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  41.9 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.2 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  43.96 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  42.86 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  38.24 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.12 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.92 
 
 
393 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  23.72 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  38.1 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  26.72 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  27.59 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.86 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>