More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1012 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  51.75 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  50.98 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  45.91 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  44.36 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  42.97 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  47.08 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  42.47 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  47.08 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  39.84 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  43.13 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  42.64 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  41.89 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  43.46 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  42.26 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  41.7 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.37 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  40.54 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  38.01 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  39.71 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  38.18 
 
 		 284 aa  151  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  37.5 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  32.56 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  38.72 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  36.58 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  35.97 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.69 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 		 244 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.69 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.69 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.07 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.07 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  29.3 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.06 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  33.19 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.91 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  34.3 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  37.74 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.6 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  28.14 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  28.19 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.72 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.2 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30.08 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.54 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.08 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.65 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  26.6 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  28.51 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  41.18 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>