243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1094 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 395 aa  806    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  32.37 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  33.65 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  30.85 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2136  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  31.48 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.1 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  29.54 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.85 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  31.49 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 280 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.61 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.51 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.17 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.17 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.17 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.17 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  29.5 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.3 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  29.07 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.91 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.3 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  26.94 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.54 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.95 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  27.93 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.57 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.6 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  27.6 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  27.6 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  23.51 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.62 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  27.62 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.57 
 
 		 327 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.49 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.96 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  23.63 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  24.21 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.05 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  21.45 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  21.85 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  21.85 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  21.78 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  22.59 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.37 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  25 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  27.15 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  21.99 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 256 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.48 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  24.83 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.89 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.7 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>