296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3578 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  76.57 
 
 		 286 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  75.52 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  74.1 
 
 		 280 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  40.27 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  38.83 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  34.6 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  33.69 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  33.94 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  35.59 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  31.07 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.87 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.87 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.87 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.87 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.87 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 		 414 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.71 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.99 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  32.62 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  30.88 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.02 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.12 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  27.55 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  29.55 
 
 		 395 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  29.5 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  31.78 
 
 		 331 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.14 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 313 aa  85.5  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.07 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.07 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  30.56 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.84 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.44 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.4 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.13 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  28.92 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.14 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.6 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.06 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  28.38 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  25.85 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  28.79 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  25.84 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.29 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  27.43 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  25.84 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  27.57 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  27.93 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.69 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.26 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  28.82 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  31.02 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  24.22 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.47 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.34 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  25.94 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.94 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>