197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1722 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  48.39 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  38.02 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  36.45 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  36.62 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  35.48 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  37 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  39.08 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  37.01 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  31.27 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  31.27 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  31.27 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  31.27 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  31.27 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.62 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.6 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  31.85 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  29.08 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  32.17 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.03 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  32.84 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  33.58 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  31.54 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  30.79 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  29.81 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  31.72 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  31.72 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  31.72 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.88 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  30.34 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.44 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  29.18 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.43 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.03 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  28.17 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.3 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  26.4 
 
 		 257 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.22 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.93 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.7 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.33 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  29.77 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  24 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  27.06 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  26.23 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.62 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  25.87 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.09 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.76 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.76 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  31.2 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  32 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.83 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.83 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>