More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0384 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  76.21 
 
 		 268 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  59.84 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  55.2 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  55.73 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  52.02 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  52.99 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  52.21 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  51.19 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  49.4 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  46.67 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  49.4 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  49.45 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  47.1 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  47.17 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.94 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  47.55 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  44.66 
 
 		 262 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  47.31 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  44.88 
 
 		 273 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  48.93 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  44.31 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  46.25 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  40.49 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  44.67 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  44.67 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  44.67 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.19 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  43.53 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.4 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  32.81 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  32.81 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  33.2 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  31.62 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  34.77 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.78 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.28 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.51 
 
 		 322 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.94 
 
 		 323 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.76 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.21 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.44 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  31.2 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.2 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  28.92 
 
 		 447 aa  72  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.59 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.21 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.74 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  26.72 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.32 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  24.64 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  24.64 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  24.64 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  24.64 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>