273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1909 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  34.73 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  35.25 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  34.35 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  32.82 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.69 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  30.21 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.64 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  29.71 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  31.75 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  32.5 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.45 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  30.68 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  30.74 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.7 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  29.88 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 		 306 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  31.98 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  23.86 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  27.86 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.01 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  29.53 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  29.88 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.07 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  29.01 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1991  ribonuclease Z  30.77 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  29.35 
 
 		 306 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.43 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  24.43 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.43 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  24.71 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  24.43 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  24.43 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.45 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.84 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.37 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.17 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  23.66 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  23.2 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  21.77 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.57 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  23.83 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>