204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1451 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  100 
 
 		 381 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  37.86 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 280 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  32.37 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  33 
 
 		 300 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.45 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  31.1 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  33.69 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  33.69 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  33.69 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.17 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  32.3 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.79 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.88 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  30.92 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  31.45 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  30.22 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  29 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  26.79 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  27.44 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  26.44 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.19 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  26.97 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  28.34 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.23 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  26.51 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.41 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  21.43 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.34 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  29.35 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  23.89 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.47 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  27.48 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.81 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.66 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.51 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.83 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.1 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  24.66 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.23 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  23.13 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.32 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.95 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.29 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25.07 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.79 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  24.35 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  23.66 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.97 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.78 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  24.34 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  23.79 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>