More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3142 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  53.57 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  48.52 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  40.16 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  31.84 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  26.98 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.59 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.16 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  27.5 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.02 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  25.53 
 
 		 320 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 309 aa  89  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 321 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.24 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  25 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.07 
 
 		 323 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  26.89 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  27.24 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  25.35 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.83 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  31.25 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  30.57 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  27.95 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  24.44 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.54 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.14 
 
 		 319 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.24 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.4 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.4 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  23.62 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  29.61 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  29.61 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.4 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.4 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.09 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.51 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.95 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.29 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.52 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.46 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  31.16 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.85 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  24.76 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.35 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.93 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.07 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>