203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0186 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  55.41 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.63 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.73 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.08 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.71 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.35 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  21.68 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.01 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  23.95 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  22.92 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.25 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  29.32 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  30.36 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  28.33 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  29.12 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  24.62 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0284  hypothetical protein  24.9 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1911  hypothetical protein  24.9 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.207411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  24.64 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  26.92 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 257 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  23.84 
 
 		 299 aa  52.4  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  23.16 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  24.07 
 
 		 447 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  25.57 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 341 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 341 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.64 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  21.5 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  30.69 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  30.69 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  30.69 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.29 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.67 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  24.5 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.24 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.86 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.86 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.17 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.96 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  26.72 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>