155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0988 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  55.41 
 
 
228 aa  276  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.98 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.56 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.54 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.8 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.43 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  32.47 
 
 
309 aa  62  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  27.27 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  27.03 
 
 
307 aa  59.3  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  23.05 
 
 
287 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.18 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 
320 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  25 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.38 
 
 
323 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  19.49 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.64 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.1 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  23.38 
 
 
322 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.11 
 
 
307 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  22.45 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.08 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.38 
 
 
341 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.38 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.38 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.38 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.43 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.38 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 
270 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  23.31 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.19 
 
 
313 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  28.95 
 
 
317 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0284  hypothetical protein  24.22 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1911  hypothetical protein  24.22 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.207411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
256 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  27.59 
 
 
312 aa  52  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  24.24 
 
 
268 aa  52  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
257 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  25.83 
 
 
267 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  22.27 
 
 
287 aa  51.6  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  22.86 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  22.86 
 
 
311 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.79 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  23.93 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  22.86 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  22.86 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  22.86 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.83 
 
 
308 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  23.32 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  25.4 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  25.11 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  22.86 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  21.86 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  21.86 
 
 
311 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.99 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  32.65 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  27.66 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.09 
 
 
309 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 
243 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  25.1 
 
 
411 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  21.79 
 
 
311 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  24.5 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  22.87 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  22.15 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  22.95 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  23.42 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 
652 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
253 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
259 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  34 
 
 
254 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
414 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  23.62 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.25 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.85 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  32.21 
 
 
308 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  24.64 
 
 
318 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  27.45 
 
 
305 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>