247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1723 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  81.18 
 
 
287 aa  490  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  80.84 
 
 
287 aa  474  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  77.7 
 
 
287 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  33.11 
 
 
291 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  33.11 
 
 
291 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  33.33 
 
 
305 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  33.11 
 
 
310 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  34.31 
 
 
314 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  34.31 
 
 
308 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  35.36 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  34.17 
 
 
306 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  33.33 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
305 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  33.81 
 
 
321 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  29.87 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  33.21 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  30.77 
 
 
315 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  32.73 
 
 
307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  34.16 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  34.09 
 
 
314 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  34.4 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  34.85 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  33.81 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  32.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  32.49 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  30.18 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  30.07 
 
 
308 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  33.45 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  29.07 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  34.89 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  33.21 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  34.53 
 
 
318 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  32.52 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  34.17 
 
 
305 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  32.73 
 
 
314 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  31.96 
 
 
310 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  30.84 
 
 
341 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  35.6 
 
 
328 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  31.88 
 
 
304 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  30.67 
 
 
341 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  31.39 
 
 
311 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  31.07 
 
 
311 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  31.17 
 
 
305 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  30.65 
 
 
305 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  30.65 
 
 
305 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  30.65 
 
 
305 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  34.4 
 
 
326 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  32.01 
 
 
312 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  31.17 
 
 
305 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  31.17 
 
 
305 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  31.17 
 
 
305 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  29.24 
 
 
307 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  30.84 
 
 
305 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  31.17 
 
 
305 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.34 
 
 
312 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  31.21 
 
 
311 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  24.2 
 
 
306 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  29.37 
 
 
307 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  30.6 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  28.67 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  28.72 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  31.05 
 
 
393 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.43 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  30.14 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  26.81 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  29.55 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  29.43 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.65 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  27.87 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  31.79 
 
 
320 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  28.93 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  29.97 
 
 
313 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  29.56 
 
 
323 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.27 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  29.47 
 
 
305 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.48 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  24.92 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  30.74 
 
 
314 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  29.35 
 
 
311 aa  92  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  30.74 
 
 
314 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  25.97 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  29.58 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  30.11 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  25.97 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  25.24 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  30.56 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.76 
 
 
313 aa  89  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  29.89 
 
 
309 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  26.62 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  29.96 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.24 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  27.3 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>