More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1162 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  87.4 
 
 		 254 aa  434  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  54.92 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.35 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  28.42 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  28.06 
 
 		 311 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.41 
 
 		 308 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.33 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.33 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.83 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.34 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 308 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 314 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 314 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.96 
 
 		 393 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.3 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  28.93 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  30.32 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  28.43 
 
 		 345 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.34 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.8 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  23.89 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  28.78 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.83 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  28.62 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.51 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  28.72 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.37 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.7 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.6 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.9 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.89 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  23.38 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  28.48 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  26.45 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.91 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  34.05 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>