More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0339 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  54.92 
 
 
257 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  53.91 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
248 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.92 
 
 
308 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 
263 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.13 
 
 
250 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  31.75 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.89 
 
 
305 aa  95.5  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  36.4 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
316 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  27.57 
 
 
305 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  30.36 
 
 
318 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.12 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  28.1 
 
 
280 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  30.07 
 
 
326 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.32 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  29.09 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.86 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.34 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.04 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.62 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  32.27 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  31.33 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.43 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.43 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.43 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.44 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.44 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  27.72 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.74 
 
 
305 aa  79  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.83 
 
 
311 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.74 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.74 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.74 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.74 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.74 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  28.28 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.62 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.38 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.67 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.62 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  31.93 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.73 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.74 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  26.62 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.4 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  22.37 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  26.78 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  28.37 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  30.8 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  28.22 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  28.83 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.54 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  26.02 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.17 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  26.67 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  29.32 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.19 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  28.28 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.01 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  26.45 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.77 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.09 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.12 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  22.7 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  24.74 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.09 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  29.77 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.09 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  28.16 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.54 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.92 
 
 
319 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.66 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.17 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>