More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0308 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  526  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  93.36 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  68.65 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  35.86 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  34.4 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  38.7 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  34.59 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.96 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  34.54 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  35.71 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.82 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  34.1 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  34.1 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.33 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  34.05 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.02 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  33.83 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.8 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.74 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  32.59 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.02 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.34 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  27.94 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  27.94 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.91 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  27.94 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.92 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  27.43 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  31.35 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  31.76 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.24 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.63 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  32.22 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.02 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.08 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  29.62 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.05 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.93 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  27.6 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  27.6 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  26.55 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>