More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2205 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  40.24 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  41.22 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  36.84 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  35.2 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  31.6 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  31.89 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  31.5 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  32.64 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  31.23 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  31.5 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  31.5 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  31.1 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  37.3 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  32.93 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  30.71 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  35.47 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.58 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.06 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  31.77 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.89 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  31.37 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  32.33 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  30.53 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  31.2 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.71 
 
 		 300 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.82 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.59 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  29.43 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  30.89 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  28.46 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  31.87 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  29.39 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  34.2 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  30.29 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  30.23 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  29.18 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  28.1 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.28 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.75 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  29.73 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.61 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  31.28 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  30.86 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.58 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.13 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  29.62 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.77 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>