279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0855 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 327 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  35.82 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  36.91 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  34.21 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  31.99 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  31.56 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  32.78 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  30.63 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  30.63 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  30.63 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  30.63 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  29.49 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  29.86 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.38 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  27.97 
 
 		 381 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.19 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.01 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.74 
 
 		 280 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  26.78 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.44 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.46 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.39 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  25.51 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  29.35 
 
 		 251 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  28.36 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.43 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.58 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  25.82 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.49 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.49 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.49 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.49 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.04 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.43 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.07 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.12 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.31 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.85 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.93 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.57 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  26.71 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  26.83 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  32.48 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  25 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  21.63 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  22.43 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.37 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.26 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.9 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.89 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  31.79 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.35 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  26.75 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  26.16 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>