297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1860 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
297 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  62.75 
 
 
244 aa  305  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  59.22 
 
 
244 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  57.2 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  51.36 
 
 
251 aa  228  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  38.22 
 
 
251 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  35.41 
 
 
250 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
263 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.12 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  26.33 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  24.4 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.82 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.82 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.82 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.82 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  24.31 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.45 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  26.46 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.9 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25.1 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  26.46 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  29.2 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  26.46 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.1 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.46 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.46 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  40.95 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  40.95 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.1 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  40.95 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  26.46 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  27.11 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.79 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  23.78 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.23 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  27.43 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.64 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  31.9 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.67 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.13 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.87 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  26.53 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.67 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  29.94 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  25.73 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  23.76 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  21.72 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  23.1 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  25.41 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  30.99 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.16 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24.66 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  25.47 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  31.92 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
243 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.76 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
246 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  26.06 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 
255 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.52 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.2 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  28.5 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  28.84 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.59 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  32.12 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.97 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.78 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  29.53 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.9 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>