153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2459 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 421 aa  880    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2136  beta-lactamase superfamily hydrolase  39.58 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.63 
 
 		 322 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  27.03 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.54 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  28.17 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  25.32 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.69 
 
 		 250 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  25.97 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.71 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  23.16 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  22.94 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  23.99 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  23.64 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.75 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.9 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  25.28 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.35 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.07 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.65 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25.5 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  22.63 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  22.76 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 		 256 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 244 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 		 244 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  23.86 
 
 		 244 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.99 
 
 		 251 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 243 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 318 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.04 
 
 		 311 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  25.27 
 
 		 288 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 243 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  23.99 
 
 		 283 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.28 
 
 		 312 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  21.84 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  21.54 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  22.47 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  20.99 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  25.13 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  25.13 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  25.13 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.33 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  23.91 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 248 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  23.79 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  27.27 
 
 		 312 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  20.6 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.55 
 
 		 312 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  23.04 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  24.9 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  20.73 
 
 		 307 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 246 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  22.63 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.53 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>