More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2397 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  47.16 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  44.73 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  40.57 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  40.57 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  40.57 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  40.57 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  40.21 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  41.61 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  40.15 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  37.59 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  33.7 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  32.65 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.28 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.34 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  31.46 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.63 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.92 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  28.95 
 
 		 414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  30.24 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  28.79 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  31.67 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.53 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.03 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  28.14 
 
 		 395 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  28.98 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  29.29 
 
 		 393 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  29.18 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  27.16 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.59 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.89 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  30.07 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.18 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  28.21 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.18 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  28.52 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  26.45 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25.34 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  30.37 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  25.82 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  28.98 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  29.91 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  29.91 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  31.16 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.18 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  25 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.18 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  29.91 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26.26 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  25.15 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.86 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  23.72 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  28.18 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.3 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>