192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  100 
 
 		 331 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  39.76 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  38.17 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  38.79 
 
 		 393 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  37.29 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  35.21 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  34.39 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  33.02 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  32.28 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  33.44 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  29.78 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  29.78 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  29.78 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  29.78 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  29.47 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  32.13 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  31.03 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.78 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.49 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30.18 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  30.56 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.93 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.87 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  29.51 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  23.01 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  30.36 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  31.78 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  31.78 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  31.78 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  29.76 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.52 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  26.91 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  26.91 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  29.55 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  31.04 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  30.15 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  28.22 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.99 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  27.17 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.06 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.79 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  21.94 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  43.96 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.36 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  23.64 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.94 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.06 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  29.23 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.49 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.53 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  25.23 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.14 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 243 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.18 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  27.68 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  21.07 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.41 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.39 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  22.79 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  26.38 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  27.19 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.38 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>