138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0182 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 381 aa  767    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  49.57 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  43.15 
 
 		 414 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  38.69 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  39.3 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  34.63 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  31.69 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  28.41 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  27.54 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  27.54 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.52 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.24 
 
 		 283 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.25 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  28.82 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  27.21 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.94 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.87 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.33 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  25.4 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.87 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  27.48 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  28.09 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  26.51 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.36 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 243 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  25.66 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  25.66 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  32.74 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 256 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  21.78 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.44 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  24.7 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.44 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.87 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.42 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  23.89 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  31.86 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 247 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  25.18 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.31 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.17 
 
 		 319 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 263 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  25 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  24.02 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  32.74 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  27 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.65 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.39 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  23.78 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  23.82 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  23.03 
 
 		 311 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.54 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  26.37 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.31 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.75 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  22.65 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.38 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>