117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0205 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  789    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  48.02 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  46.43 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  38.71 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  33.6 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  33.83 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  37.05 
 
 		 331 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  31.7 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  30.09 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  30.09 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  30.09 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  30.09 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  30.09 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  30.09 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.74 
 
 		 280 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.4 
 
 		 323 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  30.15 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  31.71 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.66 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.14 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  30.83 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  30.14 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  29.5 
 
 		 286 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 288 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 285 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 285 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  29.79 
 
 		 285 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  25.48 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.04 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.12 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  26.56 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  24.13 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.15 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  27.35 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  30.26 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 319 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.17 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.28 
 
 		 319 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.09 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  26.98 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.85 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 237 aa  50.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 257 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.34 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.09 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  21.14 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  24.29 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  25.55 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.4 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  21.27 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.14 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  28.28 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  27.37 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.02 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  23.76 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  22.33 
 
 		 312 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1720  hypothetical protein  39.29 
 
 		 104 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.896172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.97 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  27.82 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  33.58 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  33.63 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  27.82 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  28.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65151  predicted protein  23.08 
 
 		 871 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  38.94 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.82 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  22.98 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 262 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  30.14 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  38 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  27.24 
 
 		 262 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>