299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0876 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  100 
 
 		 328 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  29.07 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  29.55 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.51 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  29.93 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  30.64 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  26.53 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  25.59 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  26.81 
 
 		 414 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.83 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  26.16 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.78 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.43 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.79 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  25.42 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  26.15 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  26.87 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  23.93 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  24.46 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  23.63 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.82 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.34 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.56 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.05 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.15 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.89 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  27.89 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  25.28 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  21.43 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.55 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  23.26 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.75 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  25.55 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.17 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  37.76 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  36.73 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  22.77 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.58 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.94 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  23.6 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.89 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.3 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  24.07 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  24.47 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  33.09 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>