More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1229 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  31.91 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  33.08 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  37.36 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.29 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  31.84 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  34.67 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 327 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 305 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.55 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  30.77 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  27.33 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.51 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.97 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.49 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  29.15 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  26.97 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  28.1 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  33.74 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  27.13 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.62 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  33.07 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  28.99 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.32 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  32.3 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  30.19 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  29.3 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.86 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  24.1 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  28.32 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.08 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  25.27 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  28.38 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.27 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.96 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  33.49 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  27.92 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  26.36 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.99 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.53 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  26.74 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.36 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.36 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>