247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1334 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  45.87 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 243 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  39.68 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  41.13 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  39.11 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  39.91 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  40.79 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.75 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  30.64 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.23 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.68 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.64 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  28.79 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  30.61 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.21 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.64 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  24.52 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.35 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  26.55 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.41 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  23.67 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  28.52 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  25.37 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  24.58 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  24.12 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.51 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  23.75 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.26 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  20.07 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  28.22 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.32 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.54 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  28.47 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  25.31 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  24.17 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  29.9 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.05 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  21.12 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  28.24 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  26.47 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  29.2 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  26.1 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.41 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  22.99 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3041  hypothetical protein  23.48 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2899  hypothetical protein  23.89 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 707 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  31.25 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  26.29 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  23.08 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  23.75 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.4 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>