163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3244 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  71.26 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  37.45 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  23.78 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  28.8 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.53 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.45 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  31.2 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  23.87 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  32.38 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25.68 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  26.09 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.85 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.91 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  33.66 
 
 		 307 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  37.23 
 
 		 322 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  42.62 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.4 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  24.05 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.54 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  36.84 
 
 		 323 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.54 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  36 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  33.7 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  23.86 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  38.03 
 
 		 373 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  33.7 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  34.44 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  32.65 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  26.55 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  22.79 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.45 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  24.27 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  32.98 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  31.63 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 557 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.77 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  31.18 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 563 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>