More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3235 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  40.08 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  34.12 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  34.14 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.85 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  30.89 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.48 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  33.93 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  27.87 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.82 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  27.37 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.73 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  30.97 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.09 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  31.06 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.48 
 
 		 305 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  28.39 
 
 		 324 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.12 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  31.99 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 321 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  28.36 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  30.04 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  29.37 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  24.64 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  28.38 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  28.04 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  27.68 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.5 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  26 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  29.08 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.6 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  28.86 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  29.18 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  27.24 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.94 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.76 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.21 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  25.6 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  25.08 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.08 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.85 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  27.64 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>