More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1994 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  96.71 
 
 		 243 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  88.26 
 
 		 247 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  64.2 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  63.79 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  49.6 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  47.56 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  47.56 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  45.12 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  46.53 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.06 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  26.04 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.26 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  29.07 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.41 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.01 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.11 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.11 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.11 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.11 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.11 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.97 
 
 		 328 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  36.63 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  27.67 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  29.53 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  33.59 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  24.9 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  31.31 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  28.85 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.43 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  36.51 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  31.65 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  33.98 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.95 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  31.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  38.54 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.83 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.83 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  28.71 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  36.51 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  32.82 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  34.62 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  29.19 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.99 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  33.62 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>