84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0751 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  40.65 
 
 
257 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 
257 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  39.43 
 
 
257 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0922  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0787  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 
280 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0367408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0797  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
288 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0750  Beta-lactamase-like  34.41 
 
 
304 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0801  beta-lactamase domain protein  34.41 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  32.81 
 
 
260 aa  139  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0809  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  25.1 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1330  hypothetical protein  24.51 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.493645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1134  hypothetical protein  28.79 
 
 
270 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.449288  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  26.17 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0588  hypothetical protein  24.31 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2993  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  39.47 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.11 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  22.3 
 
 
261 aa  52  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 
319 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  36.84 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  22.53 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  23.68 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  22.83 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  23.68 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  23.68 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  19.79 
 
 
312 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  19.79 
 
 
312 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  19.79 
 
 
312 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  19.79 
 
 
312 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  19.79 
 
 
312 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  21.18 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  24.24 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  20.51 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  23.25 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  21.46 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  23.2 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  24.43 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  23.25 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  23.25 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  30.49 
 
 
316 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  33.33 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  20.59 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  19.73 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  27.47 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  20.6 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  19.63 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  21.46 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  22.69 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  23.18 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.52 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  22.75 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  28.74 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  30.26 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  22.02 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1407  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  22.02 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  32 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  27.37 
 
 
304 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
833 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.47 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
255 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.52 
 
 
268 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  22.46 
 
 
253 aa  42  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  36.36 
 
 
318 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>