63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0235 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0235  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0588  hypothetical protein  87.22 
 
 
266 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1330  hypothetical protein  88.72 
 
 
266 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.493645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0654  hypothetical protein  71.86 
 
 
268 aa  395  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1134  hypothetical protein  53.82 
 
 
270 aa  293  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.449288  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  42.31 
 
 
260 aa  201  9e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1373  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1628  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1510  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0797  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 
288 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0750  Beta-lactamase-like  29.07 
 
 
304 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0801  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
288 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0922  hypothetical protein  27.8 
 
 
258 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0787  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
280 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0367408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0751  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2993  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0809  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.32 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  24.89 
 
 
244 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  24.89 
 
 
244 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  24.45 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.32 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  24.47 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.21 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.38 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  21.94 
 
 
244 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  21.83 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  22.37 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  23.08 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  21.96 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.23 
 
 
235 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  21.76 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 
245 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  26.76 
 
 
707 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  21.52 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  21.38 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  20.69 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  22.71 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.17 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  21.88 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  27.78 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  21.74 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  22.84 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25 
 
 
265 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.5 
 
 
291 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>