250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0495 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  73.19 
 
 		 235 aa  367  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  68.09 
 
 		 235 aa  353  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  65.53 
 
 		 235 aa  333  9e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 304 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  25.78 
 
 		 447 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.94 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 287 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  24.11 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  33.14 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.58 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.36 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  29.22 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.45 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  25.79 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  25.73 
 
 		 748 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  25.3 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.32 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.32 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.87 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.89 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.26 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  34.15 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  25.45 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  25.42 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  22.13 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  25.29 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  22.13 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  25.11 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.61 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  27.75 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.05 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.38 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 305 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.43 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 309 aa  52  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  31.63 
 
 		 780 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>