134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5955 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 276 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  94.57 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  61.96 
 
 		 276 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  62.41 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  44.69 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  42.18 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 278 aa  224  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  40.71 
 
 		 320 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  44.81 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  40.94 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  38.83 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  41.26 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 308 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  38.18 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  39.7 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  34.51 
 
 		 603 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  34.95 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.81 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.14 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  33.8 
 
 		 607 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.34 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 295 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  31.87 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  30.57 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  30.83 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.65 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.07 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.77 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.73 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  22.46 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.26 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.65 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  23.77 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  27.49 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  21.38 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  21.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  32.35 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.99 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  23.1 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  23.53 
 
 		 328 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.7 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  20.34 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  21.3 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  19.57 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.25 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.87 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.2 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.06 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.78 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.06 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  23.91 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  20.75 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.11 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  24.03 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  32.18 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  23.93 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 422 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  29.89 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  19.6 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  21.97 
 
 		 250 aa  45.4  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.46 
 
 		 304 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.12 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.9 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>