292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1710 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  73.19 
 
 		 235 aa  383  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  70.82 
 
 		 235 aa  366  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  70.64 
 
 		 235 aa  353  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.33 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  31.05 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.57 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.63 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  28.97 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  28.63 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.27 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  29 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.13 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  30.36 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00100  3' tRNA processing endoribonuclease, putative  26.16 
 
 		 1037 aa  65.5  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0118695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  29.15 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  28.4 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.74 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.78 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  30.33 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.19 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  31.53 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 341 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.14 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  24.81 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.89 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  24.39 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  32.03 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.39 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  27.97 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  23.33 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.18 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.56 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.36 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  25.89 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  25.89 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>