155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00100 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00100  3' tRNA processing endoribonuclease, putative  100 
 
 		 1037 aa  2136    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0118695  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65151  predicted protein  24.97 
 
 		 871 aa  202  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00951  putative b-zip transcription factor (Eurofung)  26.78 
 
 		 1728 aa  196  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984135 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  29.36 
 
 		 748 aa  187  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  34.87 
 
 		 447 aa  156  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  33.99 
 
 		 780 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  29.97 
 
 		 314 aa  92  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  28.72 
 
 		 309 aa  91.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 306 aa  90.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 341 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 341 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.52 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  29.25 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  26.32 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.78 
 
 		 307 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.04 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 302 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 318 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.43 
 
 		 314 aa  80.1  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.43 
 
 		 314 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 305 aa  79.7  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.29 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.99 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  28.71 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.38 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  27.92 
 
 		 319 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  28.06 
 
 		 319 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  27.51 
 
 		 309 aa  76.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  29.57 
 
 		 305 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  29.21 
 
 		 287 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  29.04 
 
 		 308 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.58 
 
 		 314 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.58 
 
 		 314 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  26.75 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 318 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.57 
 
 		 309 aa  74.3  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  28.95 
 
 		 321 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 291 aa  73.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  28.76 
 
 		 328 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 308 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  27.87 
 
 		 316 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 322 aa  73.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.3 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.57 
 
 		 313 aa  72  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.7 
 
 		 307 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 303 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  27.04 
 
 		 319 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  29.7 
 
 		 312 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.03 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.03 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.03 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.03 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  29.05 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.03 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  24.73 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2067  ribonuclease Z  24.91 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  26.96 
 
 		 316 aa  67  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 318 aa  67  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.21 
 
 		 312 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  21.45 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  29.47 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.52 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.51 
 
 		 308 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  44.44 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  27.16 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.6 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.67 
 
 		 251 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  44.87 
 
 		 318 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  28.47 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  26.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  39.74 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>